Hakone Ekiden: Our Story, büyük yarışa yeniden damga vurmak isteyen üniversiteli atletlerin fiziksel ve duygusal sınavını anlatıyor. Hakone Ekiden’e dönüş yolunda takım içindeki bağlar, rekabet ve geçmiş başarısızlıklar sürekli gündeme gelir. Sporcular zafer için hazırlanırken televizyon yapımcıları da onların hikâyesini milyonlara ulaştırmak amacıyla perde arkasında ayrı bir mücadele yürütür. Her iki taraf da başarı için sınırlarını zorlamak zorundadır.
Saeki Chiharu ile Toda Wataru, aynı lisede okuyan ve filmlere tutkuyla bağlı iki gençtir. Ortak hobileri onları bir araya getirirken sinema üzerine başlayan sohbetleri zamanla güçlü bir arkadaşlığa dönüşür. Birlikte film izlemek ve yeni anılar biriktirmek, ikisinin de hayatının vazgeçilmez bir parçası hâline gelir. Ancak yaz ilerledikçe aralarındaki yakınlığın sıradan bir arkadaşlıktan farklı olduğunu hissetmeye başlarlar. Söylenemeyen duygular ve küçük tereddütler ilişkilerini karmaşıklaştırırken Chiharu ile Wataru, hem birbirlerini hem de kendi hislerini anlamaya çalışır. Bu yaz, ikisi için de büyümenin ve ilk kez gerçekten âşık olmanın anlamını keşfettikleri özel bir döneme dönüşür.